Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VldlrP98156 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VldlrP98156 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VldlrP98156 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VldlrP98156 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VldlrP98156 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VldlrP98156 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
VldlrP98156 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VldlrP98156 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VldlrP98156 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms