Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lama4P97927 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lama4P97927 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lama4P97927 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama4P97927 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Lama4P97927 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lama4P97927 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lama4P97927 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Lama4P97927 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lama4P97927 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lama4P97927 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms