Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
AlkP97793 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
AlkP97793 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
AlkP97793 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
AlkP97793 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
AlkP97793 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
AlkP97793 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
AlkP97793 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
AlkP97793 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
AlkP97793 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
AlkP97793 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
AlkP97793 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
AlkP97793 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
AlkP97793 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AlkP97793 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AlkP97793 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AlkP97793 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AlkP97793 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AlkP97793 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
AlkP97793 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AlkP97793 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AlkP97793 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AlkP97793 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AlkP97793 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
AlkP97793 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AlkP97793 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AlkP97793 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AlkP97793 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
AlkP97793 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AlkP97793 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AlkP97793 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AlkP97793 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
AlkP97793 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
AlkP97793 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
AlkP97793 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
AlkP97793 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
AlkP97793 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
AlkP97793 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
AlkP97793 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
AlkP97793 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
AlkP97793 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AlkP97793 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
AlkP97793 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AlkP97793 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AlkP97793 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AlkP97793 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
AlkP97793 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AlkP97793 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AlkP97793 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AlkP97793 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AlkP97793 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
AlkP97793 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
AlkP97793 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
AlkP97793 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
AlkP97793 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
AlkP97793 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
AlkP97793 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
AlkP97793 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
AlkP97793 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
AlkP97793 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
AlkP97793 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
AlkP97793 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
AlkP97793 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AlkP97793 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AlkP97793 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
AlkP97793 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
AlkP97793 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
AlkP97793 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
AlkP97793 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
AlkP97793 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
AlkP97793 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
AlkP97793 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
AlkP97793 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
AlkP97793 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
AlkP97793 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
AlkP97793 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
AlkP97793 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
AlkP97793 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
AlkP97793 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
AlkP97793 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
AlkP97793 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
AlkP97793 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
AlkP97793 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
AlkP97793 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
AlkP97793 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
AlkP97793 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
AlkP97793 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
AlkP97793 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
AlkP97793 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
AlkP97793 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
AlkP97793 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
AlkP97793 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
AlkP97793 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
AlkP97793 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
AlkP97793 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
AlkP97793 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
AlkP97793 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
AlkP97793 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
AlkP97793 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
AlkP97793 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms