Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atp1b3P97370 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp1b3P97370 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b3P97370 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms