Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrp1P97333 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrp1P97333 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nrp1P97333 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrp1P97333 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrp1P97333 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrp1P97333 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrp1P97333 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrp1P97333 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.8 ms