Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp1P97309 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mesp1P97309 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms