Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad54lP70270 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54lP70270 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rad54lP70270 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad54lP70270 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms