Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf5P70191 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf5P70191 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf5P70191 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf5P70191 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf5P70191 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf5P70191 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf5P70191 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf5P70191 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf5P70191 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf5P70191 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf5P70191 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf5P70191 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf5P70191 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf5P70191 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf5P70191 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf5P70191 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf5P70191 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms