Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b6P59708 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b6P59708 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms