Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn4P57780 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn4P57780 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn4P57780 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn4P57780 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn4P57780 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn4P57780 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn4P57780 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn4P57780 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms