Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pcbp4P57724 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcbp4P57724 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms