Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GemP55041 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GemP55041 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GemP55041 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GemP55041 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GemP55041 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GemP55041 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GemP55041 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GemP55041 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GemP55041 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GemP55041 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GemP55041 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GemP55041 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GemP55041 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GemP55041 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GemP55041 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GemP55041 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GemP55041 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GemP55041 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GemP55041 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GemP55041 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GemP55041 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GemP55041 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GemP55041 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GemP55041 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GemP55041 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GemP55041 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GemP55041 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GemP55041 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GemP55041 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GemP55041 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GemP55041 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GemP55041 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GemP55041 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GemP55041 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GemP55041 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GemP55041 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GemP55041 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GemP55041 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GemP55041 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GemP55041 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GemP55041 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GemP55041 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GemP55041 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GemP55041 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GemP55041 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GemP55041 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GemP55041 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GemP55041 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GemP55041 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GemP55041 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GemP55041 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GemP55041 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GemP55041 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GemP55041 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GemP55041 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GemP55041 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GemP55041 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GemP55041 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GemP55041 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GemP55041 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GemP55041 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GemP55041 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GemP55041 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GemP55041 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GemP55041 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GemP55041 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GemP55041 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GemP55041 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GemP55041 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GemP55041 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GemP55041 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GemP55041 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GemP55041 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GemP55041 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GemP55041 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GemP55041 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GemP55041 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GemP55041 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GemP55041 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GemP55041 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GemP55041 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GemP55041 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GemP55041 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GemP55041 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GemP55041 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GemP55041 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GemP55041 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GemP55041 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GemP55041 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms