Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacnb3P54285 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacnb3P54285 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms