Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pms2P54279 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pms2P54279 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pms2P54279 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pms2P54279 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pms2P54279 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pms2P54279 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pms2P54279 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pms2P54279 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pms2P54279 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pms2P54279 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms