Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stmn1P54227 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stmn1P54227 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stmn1P54227 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stmn1P54227 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stmn1P54227 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stmn1P54227 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stmn1P54227 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stmn1P54227 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stmn1P54227 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stmn1P54227 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms