Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SqleP52019 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SqleP52019 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SqleP52019 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SqleP52019 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SqleP52019 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SqleP52019 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SqleP52019 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SqleP52019 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SqleP52019 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SqleP52019 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SqleP52019 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SqleP52019 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SqleP52019 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SqleP52019 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SqleP52019 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SqleP52019 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SqleP52019 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SqleP52019 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SqleP52019 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SqleP52019 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SqleP52019 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SqleP52019 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SqleP52019 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SqleP52019 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SqleP52019 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SqleP52019 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SqleP52019 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SqleP52019 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SqleP52019 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SqleP52019 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SqleP52019 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SqleP52019 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SqleP52019 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SqleP52019 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SqleP52019 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SqleP52019 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SqleP52019 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SqleP52019 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SqleP52019 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SqleP52019 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SqleP52019 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SqleP52019 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SqleP52019 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SqleP52019 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SqleP52019 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SqleP52019 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SqleP52019 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SqleP52019 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SqleP52019 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SqleP52019 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SqleP52019 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SqleP52019 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SqleP52019 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SqleP52019 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SqleP52019 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SqleP52019 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SqleP52019 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SqleP52019 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SqleP52019 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SqleP52019 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SqleP52019 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SqleP52019 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SqleP52019 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SqleP52019 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SqleP52019 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SqleP52019 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SqleP52019 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SqleP52019 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SqleP52019 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SqleP52019 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SqleP52019 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SqleP52019 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SqleP52019 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SqleP52019 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SqleP52019 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SqleP52019 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SqleP52019 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SqleP52019 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SqleP52019 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SqleP52019 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SqleP52019 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SqleP52019 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SqleP52019 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SqleP52019 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SqleP52019 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SqleP52019 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SqleP52019 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SqleP52019 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SqleP52019 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SqleP52019 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SqleP52019 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SqleP52019 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SqleP52019 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SqleP52019 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SqleP52019 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SqleP52019 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SqleP52019 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SqleP52019 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SqleP52019 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms