Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl11P48298 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl11P48298 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms