Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SrprbP47758 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrprbP47758 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrprbP47758 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrprbP47758 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrprbP47758 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SrprbP47758 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrprbP47758 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrprbP47758 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrprbP47758 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms