Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf5P43027 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf5P43027 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms