Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd9P40240 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd9P40240 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd9P40240 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd9P40240 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd9P40240 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd9P40240 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd9P40240 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd9P40240 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd9P40240 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd9P40240 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd9P40240 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd9P40240 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd9P40240 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms