Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin1P35438 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin1P35438 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin1P35438 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin1P35438 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin1P35438 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin1P35438 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin1P35438 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin1P35438 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin1P35438 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin1P35438 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin1P35438 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin1P35438 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin1P35438 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin1P35438 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin1P35438 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms