Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stfa1P35175 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms