Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp13P33435 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms