Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bmi1P25916 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bmi1P25916 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms