Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou2f1P25425 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou2f1P25425 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou2f1P25425 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou2f1P25425 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou2f1P25425 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou2f1P25425 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou2f1P25425 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou2f1P25425 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou2f1P25425 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1082.6 ms