Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RarbP22605 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RarbP22605 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RarbP22605 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RarbP22605 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RarbP22605 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RarbP22605 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RarbP22605 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RarbP22605 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RarbP22605 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RarbP22605 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RarbP22605 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RarbP22605 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RarbP22605 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RarbP22605 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RarbP22605 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RarbP22605 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RarbP22605 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RarbP22605 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RarbP22605 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RarbP22605 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RarbP22605 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RarbP22605 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RarbP22605 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RarbP22605 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RarbP22605 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RarbP22605 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RarbP22605 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RarbP22605 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RarbP22605 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RarbP22605 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RarbP22605 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RarbP22605 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RarbP22605 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RarbP22605 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RarbP22605 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RarbP22605 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RarbP22605 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RarbP22605 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RarbP22605 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RarbP22605 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RarbP22605 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RarbP22605 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RarbP22605 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RarbP22605 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RarbP22605 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RarbP22605 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RarbP22605 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RarbP22605 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RarbP22605 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RarbP22605 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RarbP22605 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RarbP22605 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RarbP22605 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RarbP22605 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RarbP22605 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RarbP22605 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RarbP22605 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RarbP22605 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RarbP22605 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RarbP22605 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RarbP22605 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RarbP22605 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RarbP22605 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RarbP22605 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RarbP22605 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RarbP22605 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RarbP22605 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RarbP22605 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RarbP22605 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RarbP22605 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RarbP22605 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RarbP22605 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RarbP22605 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RarbP22605 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RarbP22605 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RarbP22605 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RarbP22605 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RarbP22605 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RarbP22605 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RarbP22605 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RarbP22605 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RarbP22605 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RarbP22605 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RarbP22605 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RarbP22605 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RarbP22605 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RarbP22605 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RarbP22605 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RarbP22605 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RarbP22605 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RarbP22605 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RarbP22605 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RarbP22605 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RarbP22605 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RarbP22605 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RarbP22605 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RarbP22605 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RarbP22605 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RarbP22605 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms