Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VimP20152 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VimP20152 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VimP20152 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VimP20152 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VimP20152 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VimP20152 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VimP20152 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VimP20152 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VimP20152 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VimP20152 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VimP20152 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VimP20152 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VimP20152 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VimP20152 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VimP20152 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VimP20152 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VimP20152 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VimP20152 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VimP20152 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VimP20152 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VimP20152 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VimP20152 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VimP20152 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VimP20152 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VimP20152 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VimP20152 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VimP20152 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VimP20152 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VimP20152 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VimP20152 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VimP20152 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VimP20152 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VimP20152 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VimP20152 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VimP20152 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VimP20152 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VimP20152 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VimP20152 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VimP20152 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VimP20152 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VimP20152 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VimP20152 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VimP20152 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VimP20152 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VimP20152 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VimP20152 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VimP20152 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VimP20152 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VimP20152 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VimP20152 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VimP20152 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VimP20152 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VimP20152 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VimP20152 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VimP20152 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VimP20152 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VimP20152 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VimP20152 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VimP20152 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VimP20152 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VimP20152 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VimP20152 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VimP20152 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VimP20152 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VimP20152 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VimP20152 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VimP20152 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VimP20152 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VimP20152 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VimP20152 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VimP20152 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VimP20152 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VimP20152 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VimP20152 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VimP20152 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VimP20152 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VimP20152 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VimP20152 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VimP20152 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VimP20152 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VimP20152 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VimP20152 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VimP20152 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VimP20152 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VimP20152 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VimP20152 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VimP20152 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VimP20152 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VimP20152 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VimP20152 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VimP20152 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VimP20152 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VimP20152 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VimP20152 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VimP20152 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VimP20152 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VimP20152 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VimP20152 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VimP20152 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms