Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrphP15331 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrphP15331 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrphP15331 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrphP15331 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrphP15331 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrphP15331 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrphP15331 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrphP15331 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrphP15331 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrphP15331 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrphP15331 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrphP15331 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrphP15331 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrphP15331 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrphP15331 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrphP15331 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrphP15331 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrphP15331 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrphP15331 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrphP15331 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrphP15331 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrphP15331 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrphP15331 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrphP15331 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrphP15331 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrphP15331 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PrphP15331 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrphP15331 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrphP15331 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrphP15331 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrphP15331 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PrphP15331 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrphP15331 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrphP15331 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrphP15331 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PrphP15331 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrphP15331 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrphP15331 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrphP15331 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrphP15331 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrphP15331 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrphP15331 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PrphP15331 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrphP15331 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrphP15331 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrphP15331 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrphP15331 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrphP15331 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrphP15331 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrphP15331 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrphP15331 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrphP15331 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrphP15331 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrphP15331 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrphP15331 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrphP15331 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrphP15331 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PrphP15331 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrphP15331 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrphP15331 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrphP15331 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrphP15331 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrphP15331 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrphP15331 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrphP15331 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrphP15331 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrphP15331 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrphP15331 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrphP15331 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrphP15331 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrphP15331 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrphP15331 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrphP15331 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrphP15331 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrphP15331 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrphP15331 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrphP15331 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrphP15331 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrphP15331 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrphP15331 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrphP15331 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrphP15331 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrphP15331 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrphP15331 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PrphP15331 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrphP15331 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrphP15331 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrphP15331 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms