Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RapsnP12672 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RapsnP12672 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RapsnP12672 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RapsnP12672 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RapsnP12672 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RapsnP12672 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RapsnP12672 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RapsnP12672 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RapsnP12672 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RapsnP12672 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RapsnP12672 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RapsnP12672 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RapsnP12672 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RapsnP12672 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RapsnP12672 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RapsnP12672 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RapsnP12672 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RapsnP12672 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RapsnP12672 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RapsnP12672 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RapsnP12672 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RapsnP12672 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RapsnP12672 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RapsnP12672 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RapsnP12672 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RapsnP12672 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RapsnP12672 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RapsnP12672 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RapsnP12672 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RapsnP12672 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RapsnP12672 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RapsnP12672 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RapsnP12672 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RapsnP12672 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RapsnP12672 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RapsnP12672 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RapsnP12672 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RapsnP12672 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RapsnP12672 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RapsnP12672 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RapsnP12672 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RapsnP12672 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RapsnP12672 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RapsnP12672 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RapsnP12672 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RapsnP12672 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RapsnP12672 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RapsnP12672 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RapsnP12672 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RapsnP12672 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RapsnP12672 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RapsnP12672 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RapsnP12672 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180 ms