Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxc6P10629 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc6P10629 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms