Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P10404 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P10404 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P10404 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P10404 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P10404 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P10404 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P10404 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P10404 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P10404 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P10404 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P10404 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P10404 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P10404 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P10404 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P10404 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P10404 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P10404 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P10404 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P10404 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P10404 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P10404 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P10404 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P10404 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P10404 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P10404 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P10404 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P10404 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P10404 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P10404 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P10404 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P10404 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P10404 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P10404 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P10404 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P10404 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P10404 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P10404 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P10404 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P10404 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P10404 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P10404 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P10404 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P10404 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P10404 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P10404 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P10404 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P10404 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P10404 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P10404 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P10404 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P10404 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P10404 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P10404 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P10404 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P10404 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P10404 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P10404 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P10404 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P10404 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P10404 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P10404 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P10404 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P10404 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P10404 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P10404 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P10404 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P10404 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P10404 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P10404 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P10404 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P10404 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
P10404 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P10404 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P10404 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P10404 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P10404 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P10404 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P10404 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P10404 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P10404 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P10404 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P10404 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P10404 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P10404 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P10404 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P10404 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P10404 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P10404 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P10404 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P10404 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P10404 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P10404 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P10404 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P10404 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P10404 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P10404 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P10404 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms