Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3P09920 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3P09920 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3P09920 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3P09920 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3P09920 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3P09920 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf3P09920 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csf3P09920 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms