Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb1P09055 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb1P09055 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb1P09055 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms