Protein–RNA interactions for Protein: P05784

Krt18, Keratin, type I cytoskeletal 18, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt18P05784 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt18P05784 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt18P05784 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt18P05784 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt18P05784 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt18P05784 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt18P05784 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt18P05784 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt18P05784 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt18P05784 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt18P05784 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt18P05784 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt18P05784 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt18P05784 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt18P05784 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt18P05784 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt18P05784 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt18P05784 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt18P05784 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.1 ms