Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PdgfrbP05622 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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