Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxa7P02830 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxa7P02830 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms