Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mtatp6P00848 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms