Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setdb1O88974 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Setdb1O88974 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Setdb1O88974 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setdb1O88974 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setdb1O88974 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setdb1O88974 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms