Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F11rO88792 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F11rO88792 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F11rO88792 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F11rO88792 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F11rO88792 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F11rO88792 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F11rO88792 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F11rO88792 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F11rO88792 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F11rO88792 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F11rO88792 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F11rO88792 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F11rO88792 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
F11rO88792 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F11rO88792 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F11rO88792 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F11rO88792 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F11rO88792 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F11rO88792 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F11rO88792 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F11rO88792 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F11rO88792 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F11rO88792 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F11rO88792 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F11rO88792 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F11rO88792 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F11rO88792 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F11rO88792 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
F11rO88792 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F11rO88792 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F11rO88792 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F11rO88792 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F11rO88792 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F11rO88792 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F11rO88792 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F11rO88792 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F11rO88792 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F11rO88792 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F11rO88792 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F11rO88792 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F11rO88792 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F11rO88792 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F11rO88792 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F11rO88792 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F11rO88792 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F11rO88792 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F11rO88792 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F11rO88792 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F11rO88792 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F11rO88792 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F11rO88792 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F11rO88792 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F11rO88792 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F11rO88792 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
F11rO88792 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F11rO88792 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F11rO88792 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F11rO88792 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F11rO88792 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F11rO88792 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F11rO88792 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F11rO88792 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F11rO88792 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F11rO88792 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F11rO88792 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F11rO88792 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F11rO88792 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F11rO88792 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F11rO88792 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F11rO88792 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F11rO88792 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F11rO88792 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F11rO88792 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
F11rO88792 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
F11rO88792 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
F11rO88792 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F11rO88792 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F11rO88792 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F11rO88792 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F11rO88792 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F11rO88792 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F11rO88792 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F11rO88792 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F11rO88792 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F11rO88792 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
F11rO88792 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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