Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1O88643 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pak1O88643 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1O88643 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1O88643 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1O88643 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1O88643 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms