Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dync1i1O88485 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dync1i1O88485 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dync1i1O88485 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms