Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6aO70546 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Kdm6aO70546 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm6aO70546 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms