Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xirp1O70373 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms