Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chrna4O70174 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrna4O70174 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms