Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb5O55234 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb5O55234 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb5O55234 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb5O55234 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb5O55234 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psmb5O55234 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psmb5O55234 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psmb5O55234 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb5O55234 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb5O55234 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb5O55234 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb5O55234 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb5O55234 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb5O55234 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb5O55234 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms