Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx4O55187 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx4O55187 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx4O55187 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx4O55187 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx4O55187 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx4O55187 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx4O55187 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx4O55187 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx4O55187 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx4O55187 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms