Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap2O55126 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap2O55126 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms