Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr1i2O54915 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1i2O54915 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1i2O54915 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms