Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbieO54910 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbieO54910 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfkbieO54910 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfkbieO54910 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfkbieO54910 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbieO54910 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbieO54910 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbieO54910 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbieO54910 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbieO54910 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NfkbieO54910 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms