Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh16O54909 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rdh16O54909 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16O54909 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms